对于轻症急性非复杂性肾盂肾炎患者，如无全身感染中毒症状且可以口服用药，可口服氟喹诺酮类、复方磺胺甲 唑、阿莫西林或阿莫西林/克拉维酸钾等药物治疗，疗程为14天。对于不能坚持多饮水或服药、依从性差、复杂性尿感或有全身感染中毒症状者，应给予静脉抗生素治疗。静脉使用氟喹诺酮类或广谱头孢菌素类抗生素联合或不联合氨基糖苷类、厄他培南或哌拉西林/他唑巴坦可覆盖足够的病原体范围。对于β-内酰胺类抗生素和喹诺酮类抗生素耐药者，可选用氨曲南治疗。对于可疑铜绿假单胞菌所致者，应考虑使用抗假单胞菌抗生素如头孢他啶、头孢吡肟、亚胺培南或美罗培南联合或不联合应用氨基糖苷类抗生素。用药过程中应根据尿培养结果选用敏感抗生素口服治疗，一般14天后改用口服抗生素治疗。

由于存在各种基础疾病，复杂性急性肾盂肾炎患者易出现肾脏皮髓质脓肿、肾周脓肿及肾乳头坏死等严重并发症，这类患者需要住院治疗。首先应该及时有效控制糖尿病、尿路梗阻等基础疾病，必要时需要与泌尿外科等相关专科医师共同治疗，否则单纯使用抗生素治疗很难治愈本病；其次，根据经验静脉使用广谱抗生素治疗。在用药期间，应该及时根据病情变化和（或）细菌药物敏感试验结果调整治疗方案，部分患者尚需联合用药，疗程至少为10~14天。