所有男性膀胱炎患者均应该除外前列腺炎。对于非复杂性急性膀胱炎可口服复方磺胺甲 唑或喹诺酮类药物治疗，剂量同女性患者，但疗程需要7天；而对于复杂性急性膀胱炎患者，可口服环丙沙星或左氧氟沙星，连续治疗7~14天。

对于急性细菌性前列腺炎患者，应根据尿培养和药敏试验结果选择敏感抗生素进行治疗。经验性治疗可选用氟喹诺酮类抗生素（环丙沙星500mg每12小时1次或左氧氟沙星500mg每日1次）或SMZ/TMP（1片每12小时1次），连续使用4~6周。不能口服或伴有严重全身感染中毒症状者应给予静脉抗生素治疗，可选用喹诺酮类抗生素联合或不联合氨基糖苷类抗生素，症状好转后改用口服抗生素治疗至完成4~6周的疗程。对于治疗无效者，应考虑是否存在前列腺脓肿。

对于复发性男性尿路感染患者，多存在解剖异常、腐生葡萄球菌或铜绿假单胞菌感染。对于复发者可长程抑菌治疗，复发时重复4~12周的治疗，尽可能纠正解剖异常。