五、裁判结果

法院依照《中华人民共和国合同法》第六条、第一百一十四条、第二百八十六条、《中华人民共和国民事诉讼法》第六十四条第一款、第七十六条之规定，判决如下：

一、被告SH公司于本判决发生法律效力之日起十日内向原告H建设公司支付工程款5940645.88元；

二、被告SH公司于本判决发生法律效力之日起十日内向原告H建设公司支付违约金508423.47元；

三、驳回原告H建设H公司的其他诉讼请求。

案件受理费73271元，由原告H建设公司负担19461元，被告SH公司负担53810元，承担缴费义务的当事人在本判决书生效之日起七日内向本院缴纳。鉴定费48618元，由原告H建设公司负担12913元，被告SH公司负担35705元，被告SH公司已经预缴的鉴定费不予退还，由原告H建设公司迳付被告SH有限公司。