二、病原体

与其他所有病毒一样，冠状病毒不能独立复制，只能在被感染的宿主细胞内借助于宿主细胞的蛋白质合成系统合成病毒蛋白，并以自身编码的依赖核糖核酸（RNA）的RNA聚合酶复制其基因组，再组装成完整的病毒颗粒释放并感染更多的宿主细胞。从病毒基因结构上看，SARS-CoV-2具有典型的冠状病毒RNA基因组结构。3种冠状病毒基因组由26 000～32 000个核糖核苷酸（SARS-CoV-2共有29 829个核糖核苷酸）组成，基本结构高度保守。冠状病毒基因组大约用67%的序列编码RNA聚合酶，剩下的基因组用于编码其他结构蛋白和辅助蛋白。目前研发的实时逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测方法大多数是在RNA聚合酶区（ORF1ab）和N结构蛋白的保守区域选定的靶标。完整的冠状病毒RNA聚合酶是一个由16个非结构蛋白质组成的复合物，除了作为RNA依赖RNA聚合酶功能外，还涉及阻断宿主细胞自身蛋白质合成，病毒蛋白加工，病毒RNA解旋、复制与组装等功能。通过RNA链的切换，可导致RNA重组，加上依赖RNA的RNA聚合酶在复制过程中容易出现碱基配对错误形成点突变，从而增加病毒基因组的多样性，是病毒进化的一个重要机制。Tang等发现SARS-CoV-2已经产生了149个突变点，并演化出了两个亚型：L型和S型，L型病毒的传染力比S型更强。病毒突变对疾病传播、药物研发和疫苗制作可产生重要影响。