乙型肝炎疫苗全程需接种3针，按照0、1、6个月程序，即接种第1针疫苗后，间隔1个月及6个月注射第2针和第3针疫苗。新生儿接种乙型肝炎疫苗要求在出生后12小时内接种，越早越好。接种部位新生儿为臀前部外侧肌肉内，儿童和成人为上臂三角肌中部肌肉内注射。

单用乙型肝炎疫苗阻断母婴传播的阻断率为87.8%。对母亲HBsAg阳性的新生儿，应在出生后24小时内尽早（最好在出生后6小时内）注射乙型肝炎免疫球蛋白（HBIg），剂量应≥100IU，同时在不同部位接种10μg重组酵母或20μg中国仓鼠卵母细胞（CHO）乙型肝炎疫苗，在1个月和6个月时分别接种第2针和第3针乙型肝炎疫苗，可显著提高阻断母婴传播的效果。也可在出生后12小时内先注射1针HBIg，1个月后再注射第2针HBIg。［对此我有一点不同的看法，曾经在某个全国性学术会议分组讨论时提出过，可以把两支乙型肝炎免疫球蛋白（HBIg）合并于婴儿出生时一次性注射，这样对于中和出生时感染的病毒显得更彻底一些，做到不留后患，不给病毒一点复制的机会。］并同时在不同部位接种一针10μg重组酵母或20μg CHO乙型肝炎疫苗，间隔1个月和6个月分别接种第2针和第3针乙型肝炎疫苗。新生儿在出生12小时（其实早于6个小时最好）内注射HBIg和乙型肝炎疫苗后，可接受HBsAg阳性母亲的哺乳。为最大限度地保证预防接种的成功率，首先要保证胎儿在出生时较为完美的接生方式，任何导致胎儿的皮肤破损或母血的接触面积过大，持续时间过长，都有可能导致接种的失败。

对于母亲HBsAg阴性的新生儿可用5μg或10μg重组酵母或10μg CHO乙型肝炎疫苗免疫；对新生儿时期未接种乙型肝炎疫苗的儿童应进行补种，剂量为5μg或10μg重组酵母或10μg CHO乙型肝炎疫苗；对成人建议接种20μg重组酵母或20μg CHO乙型肝炎疫苗。对免疫功能低下或无应答者，应增加疫苗的接种剂量（如60μg）和针次；对3针免疫程序无应答者可再接种3针，并于第2次接种3针乙型肝炎疫苗后1～2个月检测血清中抗-HBs，如仍无应答，可接种1针60μg重组酵母乙型肝炎疫苗。如再无抗体产生就不要再打了。有一位疾病预防控制中心的同仁谈及此事时说，这一类人即使不出抗体今后也不容易感染乙肝病毒，至于为什么，道理并不是很清楚。

接种乙型肝炎疫苗后产生抗体应答者的保护效果一般至少可持续12年，因此，一般人群不需要进行抗-HBs监测或加强免疫。