第1章 R语言编程与绘图基础

1.1 学术图表的基本概念

学术图表是为论文结论（conclusion）提供证据的视觉方式。所以，论文作者为了产生强烈的视觉效果，应该通过分析实验数据，精心设计可视化图表。本书开篇先跟大家讲讲学术图表的类型。通常学术论文中主要有三类图表，如图1-1-1所示。流程示意图和数据展示图都是非常讲究技能的图表，本书重点讲解的是数据展示图。

图1-1-1 不同类型的图表[1]

1．数据展示图：先根据数据绘制成图表，再将其导出生成图片，主要包括各种点线图、柱形图、饼图等统计图表，一般使用Excel、GraphPad Prism、SigmaPlot、Origin、MATLAB、Python、R等专业绘图软件绘制（Excel并非如大众所说不能导出高分辨率的图片和矢量图）。注意，保存图片时，一定要保存成高分辨率的TIFF格式和EPS矢量格式的图片，因为矢量图片是可以使用图片处理软件进行再编辑的。由数据生成的图表是可重复修改的，因此一定要保存好原始数据，一旦发现图表有任何问题就可以进行修改。

2．实验拍摄图：使用设备或者仪器拍摄采集的图片，包括显微镜、扫描仪及摄像机等所拍照片。一定要在最刚开始时就拍成高清的（设置成高分辨率），也就是要保证原始图片的高分辨率，接下来处理图片就会比较方便，免得因为图片质量不佳而重复实验。必要的话，把每张图片存储成TIFF和JPG两种格式（以应对部分期刊的特殊要求）。

3．流程示意图：使用简明的线条、基本图形和箭头等绘制论文中的重要的实验流程或步骤，用以说明基本原理或解释文字材料，一般使用PPT、Visio、Illustrator、CorelDRAW、3DMax等软件绘制。