临床疼痛诊断的建立离不开正确、认真的病史采集和体格检查，虽然当前的临床辅助检查日趋增多与精确，但不论这些检查是如何精密与细致，毕竟只是诊断过程中的一个步骤，那种把获得诊断的希望完全寄托在检查项目的阳性结果上的想法，显然是不当的，这等于取消了一个更重要的诊断步骤—逻辑思维过程。

疼痛诊断的建立需要一段认识过程，因为引起疼痛的疾病状态常常不是静止的，由于新的病情出现，可能否定原来的初步诊断，新的印象又需要做另一些检查来证实。即使初步证实了诊断，也需在病情变化的情况下再进一步检查或以治疗效果去检验，以至最后获得能够反映疾病本质的正确诊断。

对于比较复杂的病情，必要时应组织有关科室共同会诊讨论，防止发生误诊、漏诊而贻误患者治疗。必要时也可以利用神经阻滞对某些疾病做出鉴别诊断，例如对上腹部疼痛的患者，行肋间或腹腔神经丛阻滞，可以鉴别疼痛的部位究竟位于腹壁浅层还是腹腔内。