第一章 概述
第一节 冠状病毒的发现与种类
冠状病毒（coronavirus，CoV）为有包膜的单股正链RNA病毒，基因组全长27.32 kb，是目前已知最大的RNA病毒，分为环曲病毒和冠状病毒两个属。冠状病毒属包括感染哺乳动物和禽类的多种亚型，分别感染人、鼠、猪、猫、犬、禽类脊椎动物。国际病毒分类委员会（International Committee on Taxonomy of Viruses，ICTV）将冠状病毒分为α-冠状病毒、β-冠状病毒、γ-冠状病毒和δ-冠状病毒4个类别，其中β-冠状病毒又分A、B、C、D 4个系。迄今为止，能导致人类感染的冠状病毒有7个，分别为：α类HCoV-229E及HCoV-NL63；β类A谱系HCoV-OC43和HCoV-HKUl、B谱系SARS-CoV和SARS-CoV-2；C谱系MERS-CoV。
大部分研究认为，冠状病毒分为4群，其中第1群、第2群、第4群为哺乳动物病毒，第3群为禽类病毒。第1群包括人冠状病毒229E（human coronavirus，HCoV-229E）、猪传染性胃肠炎病毒（porcine transmissible gastroenteritis virus，TGEV）、猪流行性腹泻病毒（porcine epidemic diarrhoea virus，PEDV）、犬冠状病毒（canine coronavirus，CCoV）和猫传染性支气管炎病毒（feline infections peritonitis virus，FCoV）；第2群包括人冠状病毒OC43（human coronavirus，HCoV-OC43）、牛冠状病毒（bovine coronavirus，BCoV）、鼠肝炎病毒（mouse hepatitis virus，MHV）、鼠涎泪腺炎冠状病毒（rat sialodacryo-adeitis coronavirus，SDAV）、猪血凝性脑脊髓炎病毒（swine hemagglutinating encephalomyelitis virus，HEV）和大鼠冠状病毒（rat coronavirus，RtCoV）；第3群包括禽传染性支气管炎病毒（avian infectious bronchitis virus，IBV）、人类肠道冠状病毒（human enteric coronavirus，HECV）、兔冠状病毒（rabbit coronavirus，RBCV）、猴冠状病毒（monkey coronavirus，MCV）、豹冠状病毒（cheetah coronavirus，CHCV）和火鸡蓝冠病病毒（turkey coronavirus，TCoV）。由于基因组与已有的冠状病毒的基因序列同源性都不高，所以第4群冠状病毒被认为包括严重急性呼吸综合征冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus，SARS-CoV）与严重急性呼吸综合征冠状病毒2（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2，SARS-CoV-2）。据研究所知，经典人冠状病毒包括两个血清型：HCoV-229E和HCoV-OC43。目前已知能感染人的冠状病毒为20世纪60年代被发现的HCoV-229E和HCoV-OC43，2003年出现的SARS-CoV，2004年被发现的人冠状病毒HCoV-NL63，2005年被发现的人冠状病毒HCoV-HKU，2012年7月在中东地区出现的新型人冠状病毒MERS-CoV，2019年12月底发现原因不明的肺炎患者感染了一种新型冠状病毒SARS-CoV-2。
SARS-CoV是非典型性肺炎SARS的病原体，感染者以发热、咳嗽等为主要特征。SARS-CoV基因组属于典型的冠状病毒基因型，具有冠状病毒的一般特点。但SARS-CoV不是任何一种已知冠状病毒的突变体，也不是已知冠状病毒的重组体。目前，病毒已在人群中消失。MERS-CoV感染者会出现急性、严重呼吸道疾病，伴有发热、咳嗽、气短及呼吸困难，部分病例出现肾衰竭和死亡。MERS-CoV与bat-CoV-HKU4和bat-CoV-HKU5的亲缘关系比较接近，基因组相似性均为70.1%，而与SARS病毒基因组相似性为54.9%。目前研究发现，MERS-CoV能够感染人类和蝙蝠的细胞，能够感染多种蝙蝠和猪，使动物成为持续感染源，病毒可能在多个物种之间传播。SARS-CoV-2的基因组是一个大约为30 kb的RNA，预计可编码16种非结构蛋白（nsp1-16）、4种结构蛋白和8种辅助蛋白。刺突糖蛋白通过与人类血管紧张素转换酶2（angiotensin-converting enzyme2，ACE2）结合来介导病毒进入，然后进行蛋白水解加工。由跨膜丝氨酸蛋白酶（TMPRSS2）、弗林（furin）蛋白酶及其他可能的肺蛋白酶引起，可触发病毒和细胞膜融合。刺突糖蛋白也是宿主中和抗体（nAbs）的主要靶标。
（郭 辉）