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一、肽键与肽平面
肽键(peptide bond)存在于蛋白质和肽分子中,是由一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基缩合形成的酰胺键。
肽键结构中的六个原子构成一个肽单位(肽单元,peptide unit,peptide group,-Cα-CO-NH-Cα-)。在肽单位中,氮原子的孤对电子与C=O键的π电子存在p-π共轭效应,因而可发生共振(图3-4①),肽键(C-N键)的键长(0.132nm)介于C-N单键(0.149nm)和C=N双键(0.127nm)之间,具有一定程度的双键性质,不能自由旋转。肽单位的六个原子共面(coplanar)——在同一个平面上,该平面被称为肽平面。肽单位几乎(99.6%)都是反式构型,即两个Cα处于肽键两侧。N-Cα键和Cα-C键可以旋转(旋转角度分别用φ和ψ表示),蛋白质构象的形成与改变是以相邻肽单位通过围绕同一个Cα旋转为基础的(图3-4②)。
图3-4 肽键共振结构和肽平面