基于NGS(Next Generation Sequencing,下一代测序技术)测序技术直接对葡萄中所有的cDNA进行测序,将测序结果与参考序列进行比对并统计测序片段的数量,对葡萄基因的表达进行绝对定量,这种技术被称为RNA-seq。其是目前葡萄转录组分析的最主流方式,此外该技术还用于检测新的转录本、单核苷酸多态性和剪接变体。RNA-seq在葡萄研究中的首次应用是2010年对‘Corvina’葡萄浆果的三个发育阶段基因表达进行的研究。