蛋白质结合位点预测及辅助分子对接
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1.5 本研究的主要工作

蛋白质-配体结合位点信息是目前研究蛋白质功能机制的主要途径,也是基于结构药物分子设计的先决条件。配体结合位点已知的情况下,可以通过定点突变、核磁共振等实验手段分析蛋白质-配体相互作用机制,也可以使用分子动力学等模拟手段观察蛋白质-配体相互作用的动态过程,还可以将实验和计算模拟两者结合起来研究分子间的相互作用机制。在基于结构的药物分子设计方面,如果靶标蛋白的结合位点已知,便可以使用分子对接方法从小分子化合物库中筛选有活性的先导化合物,或者使用分子片段生长方法生成全新的活性小分子。本书旨在介绍蛋白质结合位点的预测方法,主要研究内容如下。