生物过程的主要内容包括蛋白质-蛋白质结合和其他配体与蛋白质结合。精确预测蛋白质分子表面可能的结合位点的位置对于很多科学及应用问题都是很有帮助的，比如，功能预测、药物靶标注释、基于靶蛋白的理性药物设计、药物副作用预测、预测蛋白质-蛋白质和蛋白质-配体复合体结构与评价蛋白质聚集或寡聚化的趋势[15]。
