第一节 DNA复制的基本特征
DNA复制(DNA replication)是指亲代DNA双链解链,两股单链分别作为模板按照碱基配对原则指导合成新的互补链,从而形成两个子代DNA的过程,是细胞增殖和多数DNA病毒复制时发生的核心事件。因此,DNA的复制实际上是基因组的复制。
无论是原核生物还是真核生物,DNA的复制合成都需要DNA模板、DNA聚合酶、dNTP原料、引物和Mg2+。DNA聚合酶催化脱氧核苷酸以3′,5′-磷酸二酯键连接合成DNA,合成方向为5′→3′,合成反应可表示如下:
Watson和Crick于1953年提出DNA的双螺旋结构模型时就推测了其复制的基本特征,并认为碱基配对原则使DNA复制和修复成为可能。现已阐明:在绝大多数生物体内,DNA复制的基本特征是相同的。
一、半保留复制
半保留复制(semiconservative replication)是指DNA复制时,亲代DNA双链解成两股单链,分别作为模板,按照碱基配对原则指导合成新的互补链,最后形成与亲代DNA相同的两个子代DNA分子,每个子代DNA分子都含有一股亲代DNA链和一股新生DNA链(图2-2)。
图2-2 半保留复制
1958年,Meselson和Stahl通过实验研究证明:DNA的复制方式是半保留复制。他们先用以15 NH4 Cl作为唯一氮源的培养基(称为重培养基)培养大肠杆菌,繁殖约15代(每代20~30分钟)使其DNA全部标记为15 N-DNA,再改用含14 NH4 Cl的普通培养基(称为轻培养基)继续培养,在不同时刻收集大肠杆菌,提取DNA。用氯化铯密度梯度离心法分析DNA(140000× g,约48小时)15 N-DNA的浮力密度最高(ρ=1.80)离心形成的条带称为高密度带,靠近离心管低端;14 N-DNA的浮力密度最低(ρ=1.65)离心形成的条带称为低密度带,离离心管顶端更近;14 N/15 N-DNA离心形成的条带称为中密度带,位于两者之间。结果表明,细菌在重培养基中增殖时合成的DNA显示为一条高密度带,转入轻培养基中繁殖的子一代DNA显示为一条中密度带,子二代DNA显示为一条中密度带和一条低密度带(图2-3)。因此,DNA的复制方式是半保留复制。
图2-3 Meselson-Stahl实验
半保留复制是DNA复制最重要的特征。DNA分子独特的双螺旋结构,为复制提供了精确的模板,碱基配对原则保证了亲代和子代遗传信息的高度保真。通过半保留复制,新形成的两个子代DNA分子的核苷酸序列均与亲代DNA完全一致,保留了亲代全部的遗传信息,保证了遗传信息传递的保守性与延续性。
二、从复制起点双向复制
DNA的解链和复制是从有特定序列的位点开始的,该位点称为复制起点(ori)。从一个复制起点引发复制的全部DNA序列是一个复制单位,称为复制子(replicon)。原核生物的染色体、质粒、噬菌体DNA通常只有一个复制起点,因而构成一个复制子;真核生物的染色体DNA有多个复制起点,因而构成多复制子,这些复制起点分别控制一段DNA的复制,并共同完成整个DNA分子的复制(图2-4①)。
图2-4 复制起点与复制方向
Cairns等用放射自显影技术(autoradiography)研究大肠杆菌DNA的复制过程,证明其先从复制起点解开双链,然后边解链边复制,所以在解链点形成分叉结构,这种结构称为复制叉(replication fork,图2-4②)。
复制叉有几种形成方式。
1.从一个复制起点启动双向解链,形成两个复制叉(图2-4②),这种方式称为双向复制(bidirectional replication)。绝大多数生物都采用这种双向复制。真核生物DNA从多个复制起点启动双向解链(图2-4①)。
2.从线性DNA两端启动相向解链,形成两个复制叉(图2-4③),例如腺病毒DNA的复制。
3.从一个复制起点启动单向解链,形成一个复制叉(图2-4④),例如质粒ColE 1的复制。
三、半不连续复制
DNA的两股链是反向互补的,但DNA新生链的合成是单向的,只能以5′→3′方向合成。因此,在一个复制叉上,一股新生链的合成方向与其模板的解链方向相同,合成与解链可以同步进行,合成是连续的,这股新生链称为前导链(leading strand);另一股新生链的合成方向与其模板的解链方向相反,只能先解开一段模板,再合成一段新生链,合成是不连续的,这股新生链称为后随链(lagging strand)。分段合成的后随链片段称为冈崎片段(Okazaki fragment,图2-5)。在一个复制叉上进行的这种DNA复制称为半不连续复制(semidiscontinuous replication)。
图2-5 半不连续复制