四、工程综合利用效益
1.防洪效益
峡江水利枢纽工程的首要开发任务是为坝址下游的南昌市和赣东大堤保护区的防洪，提高其防洪标准。
南昌市2006年城市建设用地面积109.0km2，总人口221.32万人；机械、电子、纺织、化工、冶金、轻工、汽车和飞机制造业比较发达，2006年南昌市工业总产值738.68亿元，地区生产总值812.67亿元，社会消费品零售总额307.49亿元，固定资产投资额507.93亿元，分别占江西省的24.4%、17.4%、21.5%和18.9%；至远期规划水平年2020年，南昌市城区总面积将达350km2，人口达350万人。赣东大堤保护区除南昌市昌南城区外，还有南昌县、丰城市、樟树市的县（市）城所在地莲塘镇、剑光镇、樟树镇（著名药都）以及南昌县、丰城市、樟树市的46个乡、镇（场），总面积2126km2，其中直接受赣东大堤保护的面积1344km2，总人口244万人（不含南昌市城区，下同），保护耕地116万亩；区内人烟稠密，城镇遍布，工厂林立，交通便利，经济发达。有向塘、樟树、洪都3座机场，京九、浙赣、向乐3条铁路和105国道、305国道、320国道、316国道等重要设施。
峡江水利枢纽工程建成后，经合理调度和水库调节，并与泉港分蓄洪区配合使用，可使坝址下游的南昌市昌南城区和昌北主城区的防洪标准由100年一遇提高到200年一遇，赣东大堤和南昌市昌北单独防护的小片区防洪堤由抗御50年一遇洪水提高到抗御100年一遇洪水；降低赣江洪水位，减轻南昌市和赣东大堤保护区的洪灾损失，经济效益和社会效益十分显著。
经分析计算，赣东大堤保护区和南昌市多年平均直接损失分别为12522万元和49718万元，考虑20%的间接损失，则峡江水利枢纽工程的多年平均防洪效益为74687万元。
2.发电效益
峡江水利枢纽工程的第二开发任务是为江西省电力系统供电区域的国民经济发展和人民生活水平的提高提供电力保障。
江西省是一个能源缺乏省份，煤炭资源蕴藏量少，且丰富的水力资源由于经济技术、水库淹没等问题，开发利用程度较低。峡江水电站是江西省流域规划中拟建的仅有的几座大型水力发电站之一，电站接入江西省电网运行。峡江水电站的建设将对江西省的能源供应产生重大的影响。峡江水电站靠近江西省负荷中心，为大（2）型电站，装机容量360MW，年发电量11.44亿kW·h，保证出力44.09MW，且水库具有一定的调节性能，将成为江西电网中的骨干水电站。工程建成后，可参与江西电网的调峰，缓解江西电网电力供需紧张状况。
按《水电建设项目经济评价规范》（DL/T 5441—2010）规定，取影子电价，并对电量实行按质论价对影子电价进行调整。依据上网电量及调整后的影子价格计算发电效益。经分析计算，峡江电站多年平均发电效益为36635万元。
3.航运效益
峡江水利枢纽工程的另一个开发任务是渠化坝址上游航道，为坝址下游增加枯水期流量，提高赣江航运保证率。
赣江流域的社会经济发展需运输大量的大宗散装货物，航运为大宗散装货物的运输提供了便利条件。航运要求在2020年以前建成峡江水利枢纽工程，使其在2020年赣江赣州以下航道全线基本建成千吨级航道标准的水运主通道的目标得以实现。峡江水利枢纽工程建成后，可渠化峡江库区航道77km（坝址至赣江干流CS39断面），使之能畅通航行千吨级船舶，并增加坝址下游的枯水流量，改善赣江中下游航道的航运条件，提高航运保证率。
按照有无项目对比分析，依据货物流量、货物运输成本及本工程渠化的航道长度，计算各水平年的航运效益。经分析计算，峡江水利枢纽工程多年平均航运效益为12788万元。
4.灌溉效益
峡江水利枢纽工程还有一个开发任务是为坝址下游沿赣江两岸耕地提供充足的灌溉水源，使该区域农田高产稳产。
峡江坝址以下沿江两岸区域内缺乏骨干蓄水工程，仍有部分农田靠天赐水，稍遇干旱就会受到严重威胁，严重阻碍着农业生产的发展。峡江水利枢纽工程建成后，从水库引水至峡江县、新干县、樟树市18 个乡（镇、场）辖区内32.95万亩农田进行灌溉，新增灌溉面积11.69万亩，改善灌溉面积21.26万亩，为该区域提供可靠的水量保障，促进农业生产的稳步发展。
灌溉效益按有无项目对比法计算增产值，采用分摊系数法（在水利和农业两部门分摊，且水源工程和灌溉渠系工程按五五分成）计算灌溉效益。经分析计算，峡江水利枢纽工程的多年平均灌溉水源效益为2360.5万元。