在生理状况下，GP以两个相同亚基组成的二聚体形式存在。在人类组织中至少已发现三种类型的GP同工酶，依据其优势表达的组织分别被命名为GPBB（脑型）、GPLL（肝型）、GPMM（肌型）。成人骨骼肌仅有一种GP同工酶——GPMM，GPLL主要由肝脏表达。GPBB为胎儿时期的主要同工酶，成年后主要在脑和心脏表达，两器官间表达量相近。尽管电泳、Western blot、Northern blot等检测结果有部分矛盾之处，但大多数文献表明，其他组织或器官如白细胞、脾、肾、睾丸、膀胱、消化道和主动脉等也可极低量地表达GPBB；这些组织中GPLL的表达占绝对优势。人体心脏可同时表达GPBB和GPMM，但GPBB的表达量占绝对优势。

GP的3种同功酶分别由3个独立的基因，分别定位于20，14，11号染色体，其cDNA已被分别克隆和测序。GPBB是两个相同的亚基构成的二聚体，分子量188kDa，其氨基酸长度为842aa。GPBB与GPLL和GPMM的氨基酸序列同源性分别为80%和83%，其差别主要是C-末端的催化域不同。GPBB的cDNA长度约为4.2kB，较GPLL及GPMM的cDNA稍大，主要原因为其3′末端非翻译区较长。Gelinas等对人胎脑GPBB的cDNA进行克隆和序列分析，发现羧基末端编码区处较Nergard等报道的cDNA（从人脑星形细胞瘤细胞系U251克隆获得）多280bp。Gelinas的结果与人脑GPBB基因组序列测定结果一致，且被针对根据他测得的cDNA序列预测的C末端多肽的单克隆抗体证实。Roscoe等对人脑星形细胞瘤细胞系U251的GPBB mRNA和基因组序列进行PCR扩增和测序证实了上述280bp同样存在于该细胞系，Nergard等的结果为使用限制性核酸内切酶PstI进行克隆和测序出现错误所致。该280bp的缺失导致GPBB的开放阅读框架（ORF）延长，得到一个错误的GPBB由862aa组成的预测。据文献报道的cDNA预测，GPBB的长度为842aa，单体分子量约为94000；而GPLL、GP-MM分别为846aa、841aa。GPBB与GPLL、GPMM的氨基酸序列的同源性分别为78%、84%。GP的羧基端为酶的催化结构域（domain），也是不同GP间氨基酸序列差别最大之处。