遗传因素在GERD发病中可能起一定作用。有证据表明GERD症状有家族群聚现象。近期对双胞胎的研究发现单卵双胞胎比双卵双胞胎更多见GERD症状，在患病人群中GERD的遗传影响因素约占30%。另一研究报道显示与配偶的亲属相比，Barrett食管和腺癌患者的亲属更有可能出现GERD症状。但这些研究没能排除双胞胎患者是否有更高的食管裂孔疝和LES解剖缺陷等因素，此外也未调查患者的家庭因素、饮食习惯、生活环境等GERD易患因素。因此遗传因素在GERD发病中的作用还有待进一步证实。